Título: Estudio genético de los genes reloj en la fisiopatología de la obesidad y diabetes tipo 2
IP: Dr. Ramón Gomis
Resumen del proyecto: En los ultimos años ha aumentado el numero de estudios que establecen una relación entre la desregulación del ciclo circadiano y un incremento en la susceptiblidad a obesidad y diabetes tipo 2. Para determinar si la desregulación del ciclo circadiano estaría más relacionada con el desarrollo de obesidad o de diabetes tipo 2, hemos decidido secuenciar las zonas promotoras y codificantes, así como las zonas 3’UTRs de los genes BMAL1, PER1, PER2, CRY1, CRY2, NR1D1, RORA y CKIe, todos ellos componentes del ciclo circadiano, en 800 pacientes obesos, con y sin diabetes tipo 2 y y 800 controles sanos, todos ellos emparejados por edad y sexo para la búsqueda de nuevos SNPs y haplotipos asociados a estas dos enfermedades. El tamaño de muestra ha sido calculado con el fin de detectar la presencia de variantes con al menos una frecuencia del 10% en pacientes con un poder estadístico del 90%.
El análisis de mutaciones será realizado mediante la amplificación por PCR de las zonas promotoras y codificantes de cada uno de los genes y posterior análisis con la técnica HRM (High Resolution Melting) realizada en el equipo de Real Time-PCR LightCycler®480 de Roche. La caracterización de las nuevas variaciones encontradas será realizada mediante secuenciación automática con el equipo 3100ABI de Applied Biosystems del servicio de DNA del Hospital Clinic, Barcelona. Posteriormente, se estudiará la frecuencia de las nuevas variantes encontradas en controles sanos y se realizará un análisis estadístico mediante modelos de regresión logística para determinar si alguna de las variantes puede asociarse a presencia de obesidad y diabetes tipo 2, así como a rasgos característicos de las mismas como el Índice de Masa Corporal (IMC), glucosa en ayunas, Hb1c%, niveles de triglicéridos, colesterol total y HDL, presencia o ausencia de complicaciones y niveles de cortisol y melatonina, indicadores del funcionamiento del ciclo circadiano.
Entidad financiadora: Ministerio de Ciencia e Innovación